Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ciao1Q99KN2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ciao1Q99KN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms