Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab28Q99KL7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab28Q99KL7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms