Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GatbQ99JT1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GatbQ99JT1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms