Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim59Q922Y2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim59Q922Y2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms