Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clip1Q922J3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clip1Q922J3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Clip1Q922J3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Clip1Q922J3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms