Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b3Q921M3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b3Q921M3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms