Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Afg3l1Q920A7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Afg3l1Q920A7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Afg3l1Q920A7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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