Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx4Q91YJ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms