Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Snx11Q91WL6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx11Q91WL6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx11Q91WL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms