Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps3Q91VB4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hps3Q91VB4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms