Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Odf4Q8VI88 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf4Q8VI88 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms