Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms