Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mark1Q8VHJ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mark1Q8VHJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms