Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps4aQ8VEJ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps4aQ8VEJ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms