Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx7Q8VDS3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms