Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc8Q8VD72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc8Q8VD72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms