Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2aQ8R0A6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2aQ8R0A6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms