Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z5

Sf3a1, Splicing factor 3A subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a1Q8K4Z5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3a1Q8K4Z5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a1Q8K4Z5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3a1Q8K4Z5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3a1Q8K4Z5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a1Q8K4Z5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms