Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hecw1Q8K4P8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms