Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rdh16f2Q8K3M1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Rdh16f2Q8K3M1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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