Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdk5rap2Q8K389 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms