Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stn1Q8K2X3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms