Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phf13Q8K2W6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf13Q8K2W6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf13Q8K2W6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf13Q8K2W6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms