Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Polr1eQ8K202 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1eQ8K202 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1eQ8K202 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms