Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sde2Q8K1J5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sde2Q8K1J5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms