Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rasgef1bQ8JZL7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms