Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ago4Q8CJF8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms