Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nupl2Q8CIC2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nupl2Q8CIC2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms