Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc43a2Q8CGA3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc43a2Q8CGA3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms