Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hpf1Q8CFE2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpf1Q8CFE2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpf1Q8CFE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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