Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp27Q8CEG8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp27Q8CEG8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Usp27Q8CEG8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Usp27Q8CEG8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Usp27Q8CEG8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Usp27Q8CEG8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Usp27Q8CEG8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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