Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup88Q8CEC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup88Q8CEC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup88Q8CEC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms