Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc178Q8CDV0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc178Q8CDV0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms