Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ4

Amer2, APC membrane recruitment protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer2Q8CCJ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Amer2Q8CCJ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Amer2Q8CCJ4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Amer2Q8CCJ4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms