Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms