Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc5Q8CAL5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc5Q8CAL5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc5Q8CAL5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc5Q8CAL5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpc5Q8CAL5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms