Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc142Q8CAI1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc142Q8CAI1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc142Q8CAI1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms