Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Podxl2Q8CAE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Podxl2Q8CAE9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms