Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg4aQ8C9S8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4aQ8C9S8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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