Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc60Q8C4J0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc60Q8C4J0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms