Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q8C3W1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q8C3W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q8C3W1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms