Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc21aQ8C0S4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc21aQ8C0S4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21aQ8C0S4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
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