Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef5Q8C0Q9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef5Q8C0Q9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef5Q8C0Q9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef5Q8C0Q9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms