Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpcpd1Q8C0L9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpcpd1Q8C0L9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gpcpd1Q8C0L9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpcpd1Q8C0L9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpcpd1Q8C0L9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms