Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccser1Q8C0C4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms