Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NkrfQ8BY02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkrfQ8BY02 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms