Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp5Q8BX09 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp5Q8BX09 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms