Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ttc12Q8BW49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc12Q8BW49 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc12Q8BW49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms