Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr9Q8BV84 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr9Q8BV84 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms