Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssc5dQ8BV57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssc5dQ8BV57 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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